Председателем ВТЭК назначается один из входящих в нее врачей, который организует работу комиссии и несет персональную ответственность за ее деятельность. Председатель, члены (врачи) комиссий, средний и младший медицинский, а также обслуживающий персонал назначаются (освобождаются) соответственно министерствами социального обеспечения, отделами исполкомов краевых, областных, районных, городских Советов народных депутатов.

В целях обеспечения общего руководства врачебно-трудовой экспертизой в республике, крае, области, городе (республиканского подчинения) назначается главный эксперт по врачебно-трудовой экспертизе. При наличии менее пяти составов республиканской, краевой, областной, центральной городской (в городах республиканского подчинения) комиссии обязанности главного эксперта возлагаются на председателя одного из составов комиссии. Следует отметить, что для проведения врачебно-трудовой экспертизы эти комиссии могут привлекать консультантов по медицинским, техническим и другим вопросам с почасовой оплатой.

Состав лечебно-профилактических учреждений, на базе которых врачебно-трудовые экспертные комиссии проводят свою работу, определяют министерства социального обеспечения союзных И автономных республик, отделы социального обеспечения исполкомов Советов народных депутатов совместно с соответствующими министерствами и отделами здравоохранения. Данные лечебно-профилактические учреждения предоставляют комиссиям помещения, медицинское и хозяйственное оборудование, необходимое для проведения экспертизы больных и хранения документов, а также обеспечивают санитарным автотранспортом для освидетельствования больных на дому. Перечень требующегося для ВТЭК оборудования и инвентаря утверждается Министерством социального обеспечения и Министерством здравоохранения союзной республики. В отдельных случаях ВТЭК могут размещаться в помещениях, предоставляемых исполкомами Советов народных депутатов.