С учетом возрастного состава больных в системе профсоюзов различаются санатории для взрослых, подростков, родителей с детьми. На базе домов отдыха профсоюзов могут создаваться санатории (санаторные отделения) для беременных женщин. Кроме того, в системе курортов функционируют санаторные пионерские лагеря круглогодичного действия.

Все санатории специализированы с учетом структуры заболеваемости населения и ее тенденций. Причем они могут быть однопрофильными (для больных с однородными заболеваниями) и многопрофильными (с двумя или более специализированными отделениями). Профиль санатория устанавливается Центральным советом по управлению курортами профсоюзов по представлениям республиканских, территориальных, краевых и областных советов по управлению курортами профсоюзов, согласованным с соответствующими советами профсоюзов.

Существуют, в частности, специализированные санатории для лечения больных с заболеваниями органов кровообращения (пороки сердца, гипертоническая болезнь и др.), пищеварения (например, хронические гастриты, язвенная болезнь желудка); больных с нарушениями обмена веществ (сахарный диабет, ожирение, подагра), заболеваниями органов движения, нервной системы, органов дыхания нетуберкулезного характера (хронические бронхиты, эмфизема легких и т. д.), гинекологическими заболеваниями, кожными заболеваниями, а также заболеваниями почек и мочевыводящих путей.

Имеются и специализированные санатории (санаторные отделения) более узкого профиля: для лечения больных бронхиальной астмой, глаукомой, сахарным диабетом, с заболеваниями и последствиями травм спинного мозга, некоторыми профессиональными заболеваниями (силикоз, антракоз, пневмокониоз, вибрационная болезнь и др.), заболеваниями периферических сосудов конечностей

В настоящее время большое внимание уделяется организации общекурортной лечебно-диагностической базы (общекурортные и кустовые лечебно-диагностические центры, кабинеты функцинальной диагностики, вычислительные центры для автоматизированной обработки результатов сбора медико-биологической информации при массовом обследовании и др.), что позволяет шире применять современные методы лечения (психотерапию, рефлексотерапию, лазеротерапию и др.).

На ряде основных курортов организованы базовые санатории различных профилей, которые ведут не только лечебную, но и организационно-методическую работу. При базовом санатории создается методический совет, в состав которого входят главный врач санатория, специалисты научно-исследовательских и медицинских институтов соответствующих специальностей, ведущие специалисты базового и других санаториев данного профиля.